O Centro de Hidrografia da Marinha possui um banco de dados de cartas náuticas do Brasil para download.

Os arquivos GeoTIFF são disponibilizados para fins acadêmicos, portanto, evite utilizar para fins comerciais (para este caso, entre em contato com a DHN da Marinha) ou para navegação, pois os arquivos não são atualizados regularmente.
As cartas raster podem ser utilizadas em um software SIG como o QGIS:

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